以金帐汗国汗国为核心，窝阔台汗国、察合台汗国与伊尔汗国三个汗国为辅助，分别统治各自区域的事务。
成吉思汗利用自己的直系血脉为纽带，进行政治统治。
这种形式在成吉思汗在世时，还是有很强的威慑力。
因为成吉思汗在蒙古人的地位不一般，他是蒙古族历史上，第一个把蒙古族彻底统一。
从某种程度上来说，成吉思汗对于蒙古族，便是中原对于秦始皇一般，可以相媲美的存在。
只是成吉思汗死后，如同大秦帝国一般，余威还能震慑一时。
血脉维持的汗国关系却是开始出现裂痕，皇权经历几次变动后，四大汗国之间的联络也出现一定的矛盾。尤其是所统治的区域，彼此之间的联络开始出现间断性。
忽必烈南征建立蒙元，夺得皇位，但并没有赢得其他汗国与部族元老的认同。
而军事上的胜利，带来的是其他汗国的排斥与敌视。为此双方进行激烈的战争冲突。尤其是海都的进攻，以两个汗国的兵力与实力，对元帝国进行攻伐。
彼此之间进行长期的战争，一度让蒙元很被动。忽必烈死后，继任者又与其继续作战，这场持续三十多年的战争，虽然最终以元帝国的胜利结束。
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